SNAPHU 動きました

エラーで止まっていたSNAPHU。
https://phreeqc.blogspot.jp/2017/10/snaphu.html

#0  0x00007f5778318694 in _IO_vfprintf_internal (s=<optimized out>,
    format=<optimized out>, ap=ap@entry=0x7ffe286718b8) at vfprintf.c:1635
1635    process_string_arg (((struct printf_spec *) NULL));

あらためて動かしてみます。

snaphu v1.4.2
27 parameters input from file snaphu.conf (84 lines total)
Logging run-time parameters to file snaphu.log
Segmentation fault

ここで「Segmentation fault SNAPHU」で googling。で、即判明。
https://yunjunz.com/2015/02/10/doris-9-segmentation-fault-error-in-snaphu/

src/snaphu_io.c の include <sys/time.h> を <time.h>に変えるだけでした。

今回は make install も止まらず。
実行してもエラーは出ません。23時間で完走です。SNAPHU 動きました。
古いPCなので時間がかかりましたが、ま、良いでしょう。

が、結果はイマイチでした。orz